Эндометрий -слизистая оболочка матки в межменструальном периоде гладкая, не имеет складок и непосредственно сращена с мышцами. Она покрыта однослойным цилиндрическим эпителием, богата капиллярными сетями и простыми трубчатыми маточными железами, пронизывающими всю толщину слизистой. В слизистой оболочке различают два слоя: толстый поверхностный функциональный, который отторгается во время менструации, и глубокий - базальный.

Эндометрий содержит эпителиальный клеточный слой, которым выложена полость матки, и более глубокий слой стромы, содержащий секреторные железы. Эндометрий снабжается кровью с помощью спиральных артерий, проходящих через миометрий к поверхности и дают начало обширной сети капилляров, пронизывающих строму. Структура как эндометрия, так и спиральных артерий сильно изменяется в течение менструального цикла. Эти изменения, которые будут описаны в последующих разделах, лежат в основе ежемесячных кровотечений (менструаций), являющихся наиболее очевидным проявлением циклической репродуктивной функции у женщин.

В преовуляторной (пролиферативной) фазе менструального цикла эндометрий имеет в толщину 1-2 мм и состоит из 3-х слоев.

Первый слой - поверхностный эпителий , образованный в основном кубовидными клетками . Под ним лежит второй слой, он образован тонкими, прямыми и короткими железистыми клетками , пространство между которыми заполнено компактной стромой .

Железы и строма составляют функциональный слой эндометрия, претерпевающий значительные изменения в ходе менструального цикла. Основания желез, и расположенные между ними клетки стромы образуют третий - базальный слой, прилегающий к миометрию . Базальный слой практически не подвергается изменению в течение цикла и из него после менструации регенерируют железы и строма.