Две формы аpо В можно разделить электрофорезом в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата натрия , поскольку аpо B48 имеет большую подвижность, чем apo B100. Однако, определить относительное содержание каждого белка трудно из-за разного сродства к красителю Кумасси голубому ( Poapst M. ea, 1987 ).

С помощью иммунохимических методов также невозможно количественно определить отдельно аpо B48 от аpо B100 , поскольку первый белок представляет собой N-концевую часть второго. Вычитая количество аpо B100, определенное с помощью моноклональных антител против C-концевой части аpо B100, из общего содержания аpо B, можно вычислить концентрацию аpо B48 в плазме, но эта величина настолько мала по сравнению с концентрацией аpо B100, что погрешность при таком подходе огромна. Хиломикроны: белкиА: apo B 100 и apo B 48: различия
Рецептор ремнантов хиломикрон
Аполипопротеин B: введение