Гены мяРНК содержат только регуляторные элементы, расположенные перед точкой инициации транскрипции. У большинства генов этого класса регуляторные элементы состоят из ТАТА-последовательности с центром в положении -30 и из проксимального элемента PSE (proximal sequence element) с центром в положении -60. Несмотря на наличие ТАТА-элемента, обычно определяющего положение точки инициации транскрипции, именно PSE фиксирует положение этой точки. Аналогичную функцию у промоторов РНК-полимеразы II выполняет ТАТА- последовательность. Состав белковых компонентов, образующих комплекс с PSE, до конца не выяснен. Обнаружены два различных PSE-связывающих белковых комплекса, названные SNAP и PTF . Активность промоторов третьего класса зависит от наличия TBP (ТАТА-связывающего белка) .