F-актин - длинный спиральный полимер, состоящий из нескольких сотен
субъединиц. Диаметр нитей равен, по данным разных авторов, 50 - 80 или 80 -
100 ангстрем. В отличие от актина образованного in vivo,
длина нитей актина, заполимеризованного in vitro, колеблется от 0,2 до 10 -
15 мкм, причем распределение по длинам экспоненциально. При взаимодействии
с тяжелым меромиозином или его субфрагментом 1
F-актин образует характерные стреловидные структуры, свидетельствующие о
полярности нитей.
Согласно модели актиновой нити ( рис.1-14б ), построенной путем совмещения атомной
структуры мономера с рентгенограммой ориентированных в капилляре полимеров,
F-актин представляет собой двухстартовую (двухтяжевую) правую спираль, шаг
которой равен 72 нм. Тяжи взаимодействуют между собой, образуя левую
спираль с шагом 5,9 нм. Большой домен находится
ближе к центру нити, а малый домен - на ее
периферии. Максимальный диаметр модельной нити равен 90 - 95 ангстрем.
Расположение мономеров в одиночной спирали актина показано на рис.1-14а .
Основное взаимодействие между
мономерами актина вдоль двухстартовой спирали осуществляется за счет
контакта между субдоменом 4 одного мономера и
субдоменом 3 лежащего выше мономера: остатки
243 - 245 и 202 - 204 контактируют с остатками 322 - 325 и 286 - 289
соответственно. Кроме того, гидрофобная петля, состоящая из остатков 41 -
50, контактирует с большим доменом лежащего выше мономера (остатки 166 -
169) и с Phe-375. Наиболее удаленным от оси нити (25 ангстрем) является
контакт петли 41 - 45 с остатками 166 - 169. В середине нить упакована
неплотно. Контакты вдоль левой генетической спирали образуются остатками
195 - 197 субдомена 4 и остатками 110 - 112
субдомена 1 . Кроме того, петля одного тяжа (266 - 269), по-видимому,
внедряется в гидрофобный карман, образованный остатками 166, 169, 171, 285,
289, 63 - 64 и 40 - 45 другого тяжа. Предполагается, что мономеры
удерживаются в полимере благодаря образованию гидрофобного ядра между
соседними субъединицами вдоль двухстартовой спирали, в которое вклинивается
"шпилька", состоящая из остатков 269 - 272, принадлежащих мономерам другого
тяжа. Взаимодействие включает 3 субъединицы. Если "шпильку" вынуть,
оставшиеся вдоль оси нити связи, по-видимому, окажутся недостаточными для
поддержания спирали.
Кроме того, взаимодействие между мономерами может
поддерживаться солевыми мостиками. Arg-39 расположен между Asp- 286 и
Glu-270 двух других субъединиц. Arg-205 одной молекулы находится между
Asp-244 и Glu-205 соседней субъединицы, Arg-62 - около Asp-288 соседа.
Существуют, вероятно, и водородные связи.
Структура нити может,
по-видимому, изменяться при гидролизе АТР, замещении прочно связанного Са++ на Mg++ и при взаимодействии с другими
белками. Эти изменения связаны, в первую очередь, с торзионным движением малого домена .
Известно, что способность
актина к полимеризации ингибируется при
ADP-рибозилировании актина , связанном с Arg- 177, модификациях His-40,
Lys-61 и Tyr-53, при замене Gly-245 на Asp, а также при протеолитическом
расщеплении связи Gly-42-Val- 43 или Met-47-Gly-48. Все эти аминокислотные
остатки находятся в области контактов между мономерами, предсказанных
моделью.
При полимеризации актина прочно
связанный нуклеотид гидролизуется, и F-актин содержит АДР. И нуклеотид, и
катион в F-актине со средой практически не обмениваются, поэтому активация
F-актина происходит медленно. В отличие от
G-актина F- актин устойчив к протеолизу и не ингибирует активность
ДНКазы I. Кроме того, F-актин взаимодействует с фаллоидином . Это взаимодействие
стабилизирует нить, приводя к необратимости полимеризации.