Латеральный гипоталамус образует двусторонние связи с верхними отделами ствола мозга , центральным серым веществом среднего мозга и с лимбической системой . Сигналы от поверхности тела и внутренних органов поступают в гипоталамус по восходящим путям через таламус или через лимбическую область среднего мозга . Эфферентные связи гипоталамуса с вегетатавными и соматическими ядрами ствола мозга и спинного мозга образованы полисинаптическими путями, идущими в составе ретикулярной формации. Медиальный гипоталамус обладает двусторонними связями с латеральным, и кроме того, непостредственно получает сигналы от некоторых отделов головного мозга . В медиальной области гипоталамуса существуют нейроны, воспринимающие важнейшие параметры крови и спинномозговой жидкости , т.е. следят за состоянием внутренней среды организма. Они могут воспринимать температуру крови, водно-электролитный состав плазмы и содержание гормонов в крови . Через нервные механизмы медиальная область гипоталамуса управляет деятельностью нейрогипофиза , а через гормональные - аденогипофиза . Таким образом, эта область служит промежуточным звеном между нервной системой и эндокринной системой .